Anonymous;Code vertelt het verhaal van Pollon Takaoka, en hoe zijn ontmoeting met het mysterieuze meisje Momo grootse wereldschuddende gebeurtenissen teweeg brengt. Het speelt zich af in 2037, in het Japanse plaatsje Tokio. Jij speelt als Pollon, die de taak krijgt om de realiteit te hacken en uiteindelijk het einde te laden die de wereld redt.
Het spel is onderdeel van de Science Adventure Series, visual novels die wetenschappelijke gebeurtenissen uit het echte leven in een fictief en spannend sausje gooit. Steins;Gate valt hier bijvoorbeeld ook onder.
